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Director: Dr. Helvin Muse
Ubicación: Finca Experimental Agropecuaria de Engombe.
Esta dependencia inicia por la resolución 98-017 del Consejo Universitario de fecha 3 de abril de 1998 donde le asigna el nombre Instituto de Estudios de las Enfermedades Zoonóticas y le designa adscrito al Consejo Directivo de la Facultad de Ciencias Agronómicas y Veterinarias.
Su primera directora fue la Dra. Norma B. Fabián Calcagno.
Función: Estudio de la investigación básica y aplicada en el campo de la salud pública y zoonosis y sus investigaciones estarán dirigidas, hacia la comprensión y divulgación en el aspecto estrictamente científico y académico de los principales problemas, estudios epidemiológicos y ecológicos relacionados con las enfermedades zoonóticas.
Actualmente tiene en carpeta dos proyectos de investigación de la leptospirosis lidereado por la Dra Raysa Reyes y otro relacionado con leishmaniosis lidereado por la Dra. Mercedes Vargas